En direct de l'Itmo Génétique, génomique et bioinformatique

Inria et en particulier l'équipe créatrice de la bibliothèque logicielle scikit-learn propose un cours gratuit en ligne: Machine learning in Python with scikit-learn. Proposé sousforme de mooc, ce cours accessible sur la plateforme FUN vise à comprendre les avantages et les limites du machine learning par la pratique. Accessible à toute personne ayant des compétences de base en programmation Python, notamment, les étudiants de Master, en particulier en Machine Learning et Data Science.

Ce mooc est basée sur des exemples d'application concrets et propose des exercices de programmation en Python exécutés par les participants dans des notebooks Jupyter, pour :

• comprendre les concepts fondamentaux de l'apprentissage automatique ;
• construire un pipeline de modélisation prédictive avec scikit-learn ;
• se familiariser avec les notions utilisées dans les modèles d’apprentissage automatique, des modèles linéaires au boosting d’arbres de décision ;
• évaluer les performances statistiques de modèles.

Informations pratiques

• Ouverture du cours: 15 février - 16 mai
• Durée du cours: 36h - au rythme de chaque participant
• Mooc gratuit, en anglais
• Inscription sur la plateforme FUN jusqu'au 8 mai.

Du 13 au 15 juin, l’Institut français de bioinformatique (IFB) organise en partenariat avec l’Institut de biologie intégrative de la cellule (I2BC) une formation destinée aux informaticiens et biostatisticiens. Les concepts FAIR, initialement définis dans le contexte d’ouverture des données de la recherche, seront ici adaptés pour cadrer avec un projet type de développement et/ou analyse bioinformatique/biostatistique et améliorer la reproductibilité des analyses.

Limitée à 15 participants, la formation est prévue en présentiel à Paris (Institut des systèmes complexes, Paris 13e), voir en distanciel en fonction de l’évolution des conditions sanitaires.

La formation aura lieu en deux temps :

• J 1 et 2 : formation théorique et pratique aux outils de la science reproductible dans un projet bioinformatique.
• J 3 : atelier optionnel de travail sur le matériel pédagogique de la formation à destination de futurs formateurs. 

Tarifs

• Académique : 200 € pour 2 jours et 300 € pour 3 jours
• Non-académique : 800 € pour 2 jours ou 1200 € pour 3 jours

Date limite de candidature : 20 avril.

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Du 13 au 18 novembre, l'Inserm, Aviesan et l’Institut français de bio-informatique proposent, à Roscoff, une initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit. La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets Next Generation Sequencing (bulk RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, single-cell RNA-Seq, et technologies long reads).

Date limite d’inscription : 31 mai 2022

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Du 25 au 30 septembre, l'Inserm, Aviesan et l’Institut français de bio-informatique, organisent à Roscoff une initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit. La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets Next Generation Sequencing  pour l'assemblage et l'annotation de novo de génomes.

Date limite d’inscription : 15 mars 2022

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L’Institut français de bioinformatique (IFB) organise du 15 au 18 novembre une formation en ligne sur la gestion de jeux de données en sciences de la vie et de la santé. Date limite d'inscription : 27 octobre.
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